Den andra kommissionen var i tjänst mellan 10 januari1962 och 5 juli1967. Även den bestod av nio kommissionärer: två från Västtyskland, Frankrike och Italien och en från Nederländerna, Belgien och Luxemburg.
15 maj1963 avgick Giuseppe Caron. Han ersattes av en ny italiensk kommissionär, som ansvarade för samma sakområde. I samband med att Guido Colonna di Paliano tog över efter Giuseppe Caron, så blev Lionello Levi Sandri även vice ordförande istället för att Paliano skulle ha tagit över den posten också efter Giuseppe Caron.