Carl Axel Rudolf Lothigius, född 24 mars 1841 på Prinsnäs i Norra Sandsjö socken, död 17 februari 1914 i Norrköping, var en svensk borgmästare. Han var bror till Wilhelm Lothigius.

Lothigius blev student vid Lunds universitet 1859, avlade hovrättsexamen 1863 och blev vice häradshövding 1867. Han var tillförordnad notarie och fiskal samt adjungerad ledamot i Göta hovrätt 1872–1876, blev assessor 1876 och var justitieborgmästare i Norrköpings stad 1884–1911. Han var verkställande direktör i Norrköping–Söderköping–Vikbolandets Järnvägs AB från 1892 och ombudsman vid Norrköpings sparbank från 1898.

Lothigius gifte sig 30 juli 1876 med Vilhelmina Henrika (Mimmi) von Malmborg (1849-1927), dotter till Adolf Malmborg. Han begravdes den 21 februari 1914 i Jönköping på stadens östra kyrkogård.

• Lothigius, Carl Axel Rudolf i K.G. Odén, Svenskt porträttgalleri (1903), volym VI. Häradshöfdingar, städernas styrelser samt Sveriges advokatsamfund
• http://www.adelsvapen.com/genealogi/Von_Malmborg_nr_2337
• Norrköpings S:t Olai FI:6