RNA-Virus
Die Einteilung der Viren in Systematiken ist kontinuierlicher Gegenstand der Forschung. So existieren neben- und nacheinander verschiedene Virusklassifikationen sowie die offizielle Virus-Taxonomie des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Die hier behandelte Gruppe ist als Taxon durch neue Forschungen obsolet geworden oder aus anderen Gründen nicht Teil der offiziellen Virus-Taxonomie.
Als RNA-Virus oder Ribonukleinsäure-Virus (Plural RNA-Viren, synonym RNS-Virus, Ribovirus) bezeichnet man Viren, deren Erbmaterial (Genom) aus RNA (Abkürzung für englisch ribonucleic acid, „Ribonukleinsäure“) besteht. Der Begriff RNA-Viren ist keine taxonomische Sammelbezeichnung und enthält keine verwandtschaftlichen Bezüge.
Eine genaue (nicht-taxonomische) Klassifikation der RNA-Viren wird in den Baltimore-Gruppen 3 (doppelsträngiges RNA-Genom), 4 (einzelsträngiges RNA-Genom positiver Polarität) und 5 (einzelsträngiges RNA-Genom negativer Polarität) und der (noch nicht ganz vollständigen) Taxonomie der Viren vorgenommen. Taxonomisch werden die RNA-Viren derzeit (Stand April 2022) in den Realms („Bereichen“) Riboviria (fast alle RNA-Viren inklusive der Retroviren und Pararetroviren, d. h. der Baltimore-Gruppen 6 bzw. 7) und Ribozyviria (Gattung Deltavirus und Verwandte der Familie Kolmioviridae, in Baltimore-Gruppe 5), sowie den beiden nicht näher klassifizierten Viroid-Familien Avsunviroidae und Pospiviroidae erfasst.
Wirte und verursachte Krankheiten
Zu den RNA-Viren gehören die meisten Pflanzenviren, viele Tierviren und einige Bakteriophagen. Ausgehend von metagenomischen Proben ist es wahrscheinlich, dass es RNA-Viren gibt, die Archaeen infizieren. Die phylogenetische Analyse der extrahierten Sequenzen deutet darauf hin, dass es sich um die am stärksten divergierenden RNA-Viren handelt und dass sie möglicherweise Vorfahren von eukaryotischen RNA-Viren sind, insbesondere der Pisuviricota, Kitrinoviricota, Duplornaviricota und Negarnaviricota, die keinen bisher bekannten prokaryotischen Vorfahren haben (Stand 2012).[1]
Die Erreger der überwiegenden Mehrheit der neu auftretenden viralen Infektionskrankheiten der letzten Jahrzehnte (Variationen der Influenzaviren, MERS-CoV, SARS-CoV, SARS-CoV-2) und Ebolavirus, aber auch das Hepatitis-D-Virus (Deltavirus) sowie die bereits jahrtausendealten Tollwut-Erreger sind RNA-Viren.
Eigenschaften
Die RNA-Viren können behüllt oder unbehüllt, die RNA einzelsträngig (ssRNA) oder doppelsträngig (dsRNA), positiv oder negativ strangorientiert, mit segmentiertem oder unsegmentiertem Genom vorliegen.
Variabilität
RNA-Viren sind aufgrund der höheren Fehlerrate der RNA-Polymerasen wesentlich variabler als DNA-Viren,[2] da ihre RNA-Polymerase meist keine proof-reading-Exonuklease-Funktion aufweist.[3][4][5] Eine Ausnahme bilden die Nidovirales, die eine Korrekturlesefunktion mit der Exoribonuklease ExoN aufweisen, wodurch die Genomgröße etwas weniger begrenzt wird.[6] Durch die hohe Mutationsrate produzieren RNA-Viren zwar mehr defekte, nicht-infektiöse virale Partikel, was aufgrund der Funktionsminderung als Fitnesskosten bezeichnet wird.[7] Sie können sich jedoch im Zuge einer Immunevasion auch schneller an neue Wirte oder Zwischenwirte anpassen sowie durch Fluchtmutation der Immunantwort entgehen.[8] Dennoch gibt es konservierte Bereiche der viralen Genome, bei denen ein hoher Selektionsdruck auf die Funktion der konservierten Sequenz wirkt. Beispielsweise gibt es beim Hepatitis-C-Virus in der Nähe des core protein einen konservierten Bereich,[9] dessen RNA eine IRES enthält.[10] Durch die im Vergleich zu DNA-Viren geringere genetische Konservierung bzw. durch die hohe genetische Variabilität müssen Impfstoffe häufiger an aktuell kursierende Virenstämme angepasst werden.[8] Ebenso ist dadurch eine zeitliche Bestimmung der Evolution der RNA-Viren im Sinne einer molekularen Uhr schwieriger.[11][12]
Wirtsresistenz
Im Zuge der Koevolution von RNA-Viren und ihren Wirten sind in den Wirten verschiedene Mechanismen zur Abwehr der RNA-Viren entstanden. Zu den Resistenzfaktoren des Menschen gegen RNA-Viren gehören unter anderem die RNA-Interferenz, einige PAMP-Rezeptoren, die Proteinkinase R. Daneben erfolgt die Immunantwort. Jedoch haben auch RNA-Viren zusätzliche Mechanismen zur Umgehung der Resistenz entwickelt.[13]
Systematik
Die RNA-Viren werden in die Baltimore-Gruppen 3, 4 und 5 klassifiziert (die aber keine taxonomische Gruppen, d. h.Verwandtschaftsgruppen, darstellen).
Gruppe III: dsRNA-Viren
Viren mit Doppelstrang-RNA-Genom werden nach Baltimore in die nicht-taxonomische Gruppe 3 klassifiziert:[14][4]
Realm Riboviria, hier nur die dsRNA-Viren
- Reich Orthornavirae, hier nur die dsRNA-Viren
- Phylum Duplornaviricota
- Klasse Chrymotiviricetes
- Ordnung Ghabrivirales
- Unterordnung Alphatotivirineae (mit Orthototiviridae,[14] Pseudototiviridae, Botybirnaviridae, Megabirnaviridae, Quadriviridae, …)
- Unterordnung Betatotivirineae (mit Megatotiviridae, …)
- Unterordnung Gammatotivirineae (mit Alternaviridae)
- Ordnung Ghabrivirales
- Klasse Resentoviricetes
- Ordnung Reovirales
- Familie Sedoreoviridae ehemals Unterfamilie Sedoreovirinae der früheren Familie Reoviridae; mit Gattungen Cardoreovirus, Mimoreovirus, Orbivirus, Phytoreovirus, Seadornavirus
- Familie Spinareoviridae ehemals Unterfamilie Sedoreovirinae der früheren Familie Reoviridae; mit Gattungen Aquareovirus, Coltivirus, Cypovirus, Dinovernavirus, Fijivirus, Idnoreovirus, Mycoreovirus, Orthoreovirus, Oryzavirus
- Ordnung Reovirales
- Klasse Vidaverviricetes
- Ordnung Mindivirales
- Familie Cystoviridae
- Ordnung Mindivirales
- Klasse Chrymotiviricetes
- Phylum Pisuviricota, hier nur die dsRNA-Viren
- Klasse Duplopiviricetes – alle dsRNA-Viren
- Ordnung Durnavirales
- Familie Amalgaviridae mit Gattungen Amalgavirus, Zybavirus[14]
- Familie Curvulaviridae
- Familie Fusariviridae
- Familie Hypoviridae
- Familie Partitiviridae mit Gattungen Alphapartitivirus, Betapartitivirus, Gammapartitivirus, Deltapartitivirus, Cryspovirus
- Familie Picobirnaviridae mit Gattung Orthopicobirnavirus
- ohne Ordnungszuweisung
- Familie Hadakaviridae
- Ordnung Durnavirales
- Klasse Duplopiviricetes – alle dsRNA-Viren
- dsRNA-Familien der Orthornavirae ohne nähere Zuordnung (incertae sedis):
- Familie Birnaviridae
- Familie Permutotetraviridae
- Phylum Duplornaviricota
- dsRNA-Familien der Riboviria ohne nähere Zuordnung (incertae sedis):
- Familie Polymycoviridae – mit Colletotrichum camelliae filamentous virus 1[15][16] (zur Spezies Polymycovirus colletotrichi)
- dsRNA-Spezies der Riboviria ohne nähere Zuordnung (incertae sedis), Vorschläge:
- Spezies „Circulifer tenellus virus 1“[17][18]
- Spezies „Spissistilus festinus virus 1“[19][20]
Gruppe IV: positive-strängige ssRNA-Viren
Viren mit Einzelstrang-RNA-Genom positiver Polarität werden nach Baltimore in die nicht-taxonomische Gruppe 4 klassifiziert:[21]
Realm Riboviria, hier nur die (+)ssRNA-Viren
- Reich Orthornavirae, hier nur die (+)ssRNA-Viren
- Phylum Kitrinoviricota
- Klasse Alsuviricetes
- Ordnung Hepelivirales
- Familie Alphatetraviridae mit Gattungen Betatetravirus, Omegatetravirus
- Familie Benyviridae mit Gattung Benyvirus (satelliten-ähnliche RNA)
- Familie Hepeviridae
- Unterfamilie Orthohepevirinae
- Unterfamilie Parahepevirinae
- Familie Matonaviridae mit Gattung Rubivirus (früher zu Togaviridae)
- Ordnung Martellivirales
- Familie Bromoviridae
- Familie Closteroviridae
- Familie Endornaviridae (früher als dsRNA klassifiziert)
- Familie Kitaviridae[22] mit Gattungen Blunervirus, Cilevirus, Higrevirus
- Familie Mayoviridae mit Gattungen Idaeovirus, Pteridovirus
- Familie Togaviridae
- Familie Virgaviridae[23]
- Ordnung Tymovirales
- Familie Alphaflexiviridae mit Gattungen Allexivirus, Botrexvirus, Lolavirus, Mandarivirus, Platypuvirus, Potexvirus, Sclerodarnavirus
- Familie Betaflexiviridae
- Unterfamilie Quinvirinae mit Gattungen Carlavirus, Foveavirus,Robigovirus
- Unterfamilie Trivirinae mit Gattungen Capillovirus, Chordovirus, Citrivirus, Divavirus, Prunevirus, Tepovirus, Trichovirus, Vitivirus
- Familie Gammaflexiviridae mit Gattungen Gammaflexivirus, Mycoflexivirus, Xylavirus
- Familie Deltaflexiviridae mit Gattung Deltaflexivirus
- Familie Tymoviridae mit Gattungen Maculavirus, Marafivirus, Tymovirus
- Ordnung Hepelivirales
- Klasse Flasuviricetes
- Ordnung Amarillovirales
- Familie Flaviviridae mit Gattungen Flavivirus, Hepacivirus, Pegivirus, Pestivirus
- Ordnung Amarillovirales
- Klasse Magsaviricetes
- Ordnung Nodamuvirales
- Familie Nodaviridae
- Familie Sinhaliviridae mit Gattung Sinaivirus[24]
- Ordnung Nodamuvirales
- Klasse Tolucaviricetes
- Ordnung Tolivirales
- Familie Carmotetraviridaeraviridae mit Gattung Alphacarmotetravirus
- Familie Tombusviridae inkl. früherer Familie Luteoviridae
- Unterfamilie Calvusvirinae
- Unterfamilie Procedovirinae
- Unterfamilie Regressovirinae (inkl. Gattung Luteovirus)
- Ordnung Tolivirales
- Klasse Alsuviricetes
- Phylum Lenarviricota
- Klasse Amabiliviricetes
- Ordnung Wolframvirales
- Familie Narnaviridae
- Ordnung Wolframvirales
- Klasse Howeltoviricetes
- Ordnung Cryppavirales
- Familie Mitoviridae
- Ordnung Cryppavirales
- Klasse Leviviricetes
- Ordnung Norzivirales
- Familie Atkinsviridae
- Familie Duinviridae
- Familie Fiersviridae (früher Leviviridae)
- Familie Solspiviridae
- Ordnunmg Timlovirales
- Familie Blumeviridae
- Familie Steitzviridae
- ohne Ordnungs- und Familienzuwisung
- Gattungen Grandbuvirus, Mahrahovirus, Nicedsevirus, Nordovirus, Skrubnovirus
- Ordnung Norzivirales
- Klasse Miaviricetes
- Ordnung Ourlivirales
- Familie Botourmiaviridae (alias Ourmiaviridae[25])
- Ordnung Ourlivirales
- Klasse Amabiliviricetes
- Phylum Pisuviricota, hier nur die (+)ssRNA-Viren
- Klasse Duplopiviricetes, hier nur die (+)ssRNA-Viren
- Ordnung Durnavirales, hier nur die (+)ssRNA-Viren
- Familie Fusariviridae[26][27][28][29] mit Gattung Alphafusarivirus,[30][31][32] Betafusarivirus, Gammafusarivirus
- Familie Hypoviridae mit Gattungen Alphahypovirus, Betahypovirus, Gammahypovirus, Deltahypovirus, Epsilonhypovirus, Zetahypovirus, Etahypovirus, Thetahypovirus
- Ordnung Durnavirales, hier nur die (+)ssRNA-Viren
- Klasse Pisoniviricetes
- Ordnung Nidovirales
- Unterordnung Abnidovirineae
- Familie Abyssoviridae
- Unterfamilie Tiamatvirinae mit Gattung Alphaabyssovirus
- Familie Abyssoviridae
- Unterordnung Arnidovirineae
- Familie Arteriviridae
- Unterfamilie Crocarterivirinae mit Gattung Muarterivirus
- Unterfamilie Equarterivirinae mit Gattung Alphaarterivirus (früher Equartevirus)
- Unterfamilie Heroarterivirinae mit Gattung Lambdaarterivirus
- Unterfamilie Simarterivirinae mit Gattungen Deltaarterivirus, Epsilonarterivirus, Etaarterivirus, Iotaarterivirus, Thetaarterivirus, Zetaarterivirus
- Unterfamilie Variarterivirinae mit Gattung Betaarterivirus, Gammaarterivirus, Nuarterivirus
- Unterfamilie Zealarterivirinae mit Gattung Kappaarterivirus
- Familie Cremegaviridae
- Unterfamilie Becregavirinae
- Unterfamilie Rodepovirinae
- Familie Gresnaviridae
- Unterfamilie Reternivirinae
- Familie Olifoviridae
- Unterfamilie Gofosavirinae
- Familie Arteriviridae
- Unterordnung Cornidovirineae
- Familie Coronaviridae
- Unterfamilie Letovirinae mit Gattung Alphaletovirus
- Unterfamilie Orthocoronavirinae mit Gattungen Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus, Deltacoronavirus
- Unterfamilie Pitovirinae mit Gattung Alphapironavirus
- Familie Coronaviridae
- Unterordnung Mesnidovirineae
- Familie Medioniviridae
- Familie Mesoniviridae
- Unterfamilie Medionivirinae mit Gattung Bolenivirus, Turrinivirus
- Unterfamilie Tunicanivirinae mit Gattung Bolenivirus
- Familie Mesoniviridae
- Unterfamilie Hexponivirinae mit Gattungen Alphamesonivirus
- Unterfamilie Menanivirinae mit Gattung Nasenivirus
- Unterfamilie Metotonivirinae mit Gattungen Tocinivirus, Tofonivirus
- Unterordnung Monidovirineae
- Familie Mononiviridae
- Unterfamilie Mononivirinae mit Gattung Alphamononivirus
- Familie Mononiviridae
- Unterordnung Nanidovirineae
- Familie Nanghoshaviridae
- Unterfamilie Chimanivirinae
- Familie Nanhypoviridae
- Unterfamilie Hyporhamsavirinae
- Familie Nanghoshaviridae
- Unterordnung Ronidovirineae
- Familie Euroniviridae
- Unterfamilie Ceronivirinae (inkl. Crustonivirinae) mit Gattungen Charybnivirus, Paguronivirus
- Familie Roniviridae
- Unterfamilie Okanivirinae mit Gattungen Nimanivirus, Okavirus
- Familie Euroniviridae
- Unterordnung Tornidovirineae
- Familie Tobaniviridae
- Unterfamilie Piscanivirinae mit Gattungen Bafinivirus, Oncotshavirus
- Unterfamilie Remotovirinae mit Gattung Bostovirus
- Unterfamilie Serpentovirinae mit Gattungen Infratovirus, Pregotovirus (inkl. früherer Gattung Tiruvirus), Sectovirus, Septovirus, Sertovirus, Vebetovirus
- Unterfamilie Torovirinae (früher Fam. Coronaviridae) mit Gattung Torovirus
- Familie Tobaniviridae
- Unterordnung Abnidovirineae
- Ordnung Picornavirales
- Familie Caliciviridae
- Familie Dicistroviridae
- Familie Iflaviridae
- Familie Marnaviridae
- Familie Noraviridae
- Familie Picornaviridae
- Unterfamilie Caphthovirinae
- Unterfamilie Ensavirinae
- Unterfamilie Heptrevirinae
- Unterfamilie Kodimesavirinae
- Unterfamilie Paavivirinae
- Gattungen ohne zugewiesene Unterfamilie: Ampivirus, Harkavirus
- Familie Polycipiviridae mit Gattungen Chipolycivirus, Hupolycivirus, Sopolycivirus
- Familie Secoviridae
- Unterfamilie Comovirinae mit Gattungen Comovirus, Fabavirus, Nepovirus
- Gattungen ohne zugewiesene Unterfamilie: Cheravirus, Sadwavirus, Sequivirus, Stralarivirus, Torradovirus, Waikavirus
- Familie Solinviviridae mit Gattungen Invictavirus, Nyfulvavirus
- Ordnung Sobelivirales
- Familie Alvernaviridae mit Gattung Dinornavirus
- Familie Barnaviridae mit Gattung Barnavirus[33]
- Familie Solemoviridae mit Gattungen Enamovirus, Hubsclerovirus, Polemovirus, Polerovirus, Sobemovirus
- Ordnung Nidovirales
- Klasse Stelpaviricetes
- Ordnung Patatavirales
- Familie Potyviridae
- Ordnung Stellavirales
- Familie Astroviridae mit Gattungen Avastrovirus,[34] Mamastrovirus,[35] „Bastrovirus“[36]
- Ordnung Patatavirales
- ohne Klassenzuweisung:
- Ordnung Yadokarivirales
- Familie Yadokariviridae
- auch ohne Ordnungszuweisung:
- Familie Hadakaviridae
- Ordnung Yadokarivirales
- ohne Klassenzuweisung
- Familie Permutotetraviridae mit Gattung Alphapermutotetravirus
- Klasse Duplopiviricetes, hier nur die (+)ssRNA-Viren
- Phylum Kitrinoviricota
- Familien ohne Zuordnung zu einem Reich und sonst einem höheren Taxon:
- Satellitenviren (informelle Gruppe), Klassifizierung nach Krupovic et al. (2016)[37]
- Familie Sarthroviridae[38][39][40][41][42]
- ohne Familienzuordnung: Gattungen Albetovirus, Aumaivirus, Papanivirus, Virtovirus
- Gattungen ohne Zuordnung zu einem Reich und sonst einem höheren Taxon (Vorschläge):
- Gattung „Negevirus“ mit Spezies „Blackford virus“, „Bofa virus“, „Buckhurst virus“, „Marsac virus“, sowie „Muthill virus“[43][44]
- Spezies ohne Zuordnung zu einem Reich und sonst einem höheren Taxon (Vorschläge):
- „Acyrthosiphon pisum virus“ (APV)[45][46]
- „Chara australis virus“ (CAV), alias „Chara corallina virus“[47][48]
- „Kelp fly virus“ (KFV)[49][50]
- „Chronic bee paralysis virus“ (CBPV)[51][52]
- „Plasmopara halstedii virus“ (PhV)[53][54]
Gruppe V: negativ-strängige ssRNA-Viren
Viren mit Einzelstrang-RNA-Genom negativer Polarität werden nach Baltimore in die nicht-taxonomische Gruppe 5 klassifiziert. In dieser Gruppe befinden sich die (-)ssRNA-Viren der Realms Riboviria sowie die Viren des kleinen Realms Ribozyviria (mit dem Deltavirus). Seit November 2018 hat das ICTV diese Viren (mit Ausnahme der Gattung Deltavirus) verschiedenen Phyla, Subphyla und Klassen zugeordnet. Im Jahr 2019 kam das Deltavirus mit seiner Verwandtschaft aus der Familie Kolmioviridae im eigens geschaffenen Realm Ribozyviria hinzu.[55][4][56]
Realm Riboviria, hier nur die (-)ssRNA-Viren
- Reich Orthornavirae, hier nur die (-)ssRNA-Viren
- Phylum: Negarnaviricota
- Subphylum: Haploviricotina
- Klasse: Chunqiuviricetes
- Klasse Milneviricetes
- Ordnung Naedrevirales (früher Serpentovirales)
- Familie Aspiviridae (früher Ophioviridae) mit Gattung Ophiovirus
- Ordnung Naedrevirales (früher Serpentovirales)
- Klasse Monjiviricetes
- Ordnung Jingchuvirales
- Familie Aliusviridae
- Familie Chuviridae mit Gattung Mivirus, …
- Familie Crepuscuviridae
- Familie Myriaviridae
- Familie Natareviridae
- Ordnung Mononegavirales (nicht segmentierte negativsträngige RNA-Viren)[57]
- Familie Artoviridae mit Gattungen Hexartovirus und Peropuvirus (früher zu Nyamiviridae)
- Familie Bornaviridae
- Familie Filoviridae
- Familie Lispiviridae mit Gattung Arlivirus (inklusive der früheren Gattungen Wastrivirus und Chengivirus/Chengtivirus),[58]
- Familie Mymonaviridae mit Gattung Sclerotimonavirus …
- Familie Mymonaviridae
- Familie Nyamiviridae mit Gattungen Berhavirus, Crustavirus (ehemals Crabvirus), Formivirus, Nyavirus Orinovirus, Socyvirus, Tapwovirus
- Familie Paramyxoviridae
- Unterfamilie Avulavirinae
- Unterfamilie Feraresvirinae
- Unterfamilie Glossavirinae
- Unterfamilie Ichthysvirinae
- Unterfamilie Kamposvirinae
- Unterfamilie Metaparamyxovirinae
- Unterfamilie Orthoparamyxovirinae
- Unterfamilie Rubulavirinae
- Unterfamilie Skoliovirinae
- Familie Pneumoviridae
- Familie Rhabdoviridae
- Unterfamilie Alpharhabdovirinae
- Unterfamilie Betarhabdovirinae
- Unterfamilie Gammarhabdovirinae
- Unterfamilie Deltarhabdovirinae
- ohne Unterfamilienzuweisung: Gattung Platrhavirus
- Familie Sunviridae mit Gattung Sunshinevirus (SunCV)
- Familie Xinmoviridae mit Gattungen Alasvirus, Anphevirus, Doupovirus, Draselvirus, Drunivirus, Gambievirus, Gylbovirus, Hoptevirus, Madalivirus, Pelmivirus, Triniovirus, Ulegvirus, …
- Ordnung Jingchuvirales
- Klasse: Yunchangviricetes
- Ordnung Goujianvirales
- Familie Yueviridae mit Gattung Yuyuevirus
- Ordnung Goujianvirales
- Subphylum: Polyploviricotina
- Klasse: Bunyaviricetes (früher Ellioviricetes)
- Ordnung Elliovirales (hervorgegangen durch Aufteilung der früheren Ordnung Bunyavirales)
- Familie Cruliviridae (ehemals vorgeschlagen als Lincruviridae) mit Gattung Lincruvirus[59]
- Familie Fimoviridae
- Familie Hantaviridae
- Unterfamilie Actantavirinae
- Unterfamilie Agantavirinae
- Unterfamilie Mammantavirinae
- Unterfamilie Repantavirinae
- Familie Peribunyaviridae
- Familie Phasmaviridae
- Familie Tospoviridae
- Familie Tulasviridae
- Ordnung Hareavirales (hervorgegangen durch Aufteilung der früheren Ordnung Bunyavirales)
- Familie Arenaviridae – die meisten Spezies gelten lt. ICTV allerdings als „(*/-)ssRNA-Viren“
- Familie Discoviridae
- Familie Konkoviridae
- Familie Leishbuviridae
- Familie Mypoviridae
- Familie Nairoviridae
- Familie Phenuiviridae
- Familie Wupedeviridae
- Ordnung Elliovirales (hervorgegangen durch Aufteilung der früheren Ordnung Bunyavirales)
- Klasse: Insthoviricetes
- Ordnung Articulavirales
- Familie Amnoonviridae mit Gattung Tilapinevirus
- Familie Orthomyxoviridae
- Ordnung Articulavirales
- Klasse: Bunyaviricetes (früher Ellioviricetes)
- ohne Zuweisung eines Suphylums bis hinunter zur Unterordnung
- Familie Tosoviridae
- Subphylum: Haploviricotina
- Phylum: Negarnaviricota
Realm Ribozyviria (zirkulär)
- Ohne Zuordnung zu einem Reich bis hinunter zur Unterordnung
- Familie Kolmioviridae mit Gattungen Daazvirus, Dagazvirus, Daletvirus, Dalvirus, Deevirus, Deltavirus, Dobrovirus, Donvirus, Perideltavirus, Perithurisazvirus, Thurisazvirus
Literatur
- D. M. Knipe, Peter M. Howley, D. E. Griffin (Hrsg.): Fields Virology. 5. Auflage, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7.
Weblinks
Commons: RNA-Virus – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien
- Nadja Podbregar: Stammbaum der RNA-Viren verdoppelt sich. Auf: scinexx.de vom 8. April 2022 (siehe Orthornavirae).
Einzelnachweise
- ↑ Benjamin Bolduc, Daniel P. Shaughnessy, Yuri I. Wolf, Eugene V. Koonin, Francisco F. Roberto, Mark Young: Identification of novel positive-strand RNA viruses by metagenomic analysis of archaea-dominated Yellowstone hot springs. In: Journal of Virology. 86. Jahrgang, Nr. 10, 24. April 2012, S. 5562–5573, doi:10.1128/JVI.07196-11, PMID 22379100, PMC 3347303 (freier Volltext) – (asm.org).
- ↑ R. Sanjuan, M. R. Nebot, N. Chirico, L. M. Mansky, R. Belshaw: Viral Mutation Rates. In: Journal of Virology. Band 84. Jahrgang, Nr. 19, 2010, ISSN 0022-538X, S. 9733–9748, doi:10.1128/JVI.00694-10 (jvi.asm.org ( des vom 25. Februar 2021 im Internet Archive) [abgerufen am 11. April 2022]). Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
- ↑ J. W. Drake, J. J. Holland: Mutation rates among RNA viruses. In: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1999, Band 96, Nr. 24, S. 13910–13913, PMID 10570172, PMC 24164 (freier Volltext).
- ↑ a b c Donald W. Klein, Lansing M. Prescott, John Harley: Microbiology. Wm. C. Brown, Dubuque, Iowa 1993, ISBN 0-697-01372-3.
- ↑ MA Martinez et al.: Viruses: Essential Agents of Life. Hrsg.: G. Witzany. Springer, 2012, ISBN 978-94-007-4898-9, Quasispecies Dynamics of RNA Viruses, S. 21–42.
- ↑ C Lauber, JJ Goeman, C Parquet Mdel, P Thi Nga, EJ Snijder, K Morita, AE Gorbalenya: The footprint of genome architecture in the largest genome expansion in RNA viruses. In: PLOS Pathogens. Band 9. Jahrgang, Nr. 7, Juli 2013, S. e1003500, doi:10.1371/journal.ppat.1003500.
- ↑ E. Domingo, G. Witzany: Quasispecies Productivity. In: The Science of Nature (Naturwissenschaften). Band 111, Nr. 2, Februar 2024, S. 11.
- ↑ a b D. A. Steinhauer, J. J. Holland: Rapid evolution of RNA viruses. In: Annual Review of Microbiology. 1987, Band 41, S. 409–433, PMID 3318675.
- ↑ J. Bukh, R. H. Purcell, R. H. Miller: Sequence analysis of the core gene of 14 hepatitis C virus genotypes. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. Band 91, Nr. 17, August 1994, S. 8239–8243, PMID 8058787, PMC 44581 (freier Volltext).
- ↑ A. Tuplin, D. J. Evans, P. Simmonds: Detailed mapping of RNA secondary structures in core and NS5B-encoding region sequences of hepatitis C virus by RNase cleavage and novel bioinformatic prediction methods. In: The Journal of general virology. Band 85, Nr. 10, Oktober 2004, S. 3037–3047, doi:10.1099/vir.0.80141-0, PMID 15448367.
- ↑ E. C. Holmes: What does virus evolution tell us about virus origins? In: Journal of Virology. 2011, Band 85, Nr. 11, S. 5247–5251. doi:10.1128/JVI.02203-10, PMID 21450811, PMC 3094976 (freier Volltext).
- ↑ M. R. Patel, M. Emerman, H. S. Malik: Paleovirology – ghosts and gifts of viruses past. In: Current Opinion in Virology. 2011, Band 1, Nr. 4, S. 304–309, doi:10.1016/j.coviro.2011.06.007, PMID 22003379, PMC 3190193 (freier Volltext).
- ↑ A. M. Dickson, J. Wilusz: Strategies for viral RNA stability: live long and prosper. In: Trends in Genetics. 2011, Band 27, Nr. 7, S. 286–293. doi:10.1016/j.tig.2011.04.003. PMID 21640425, PMC 3123725 (freier Volltext).
- ↑ Henxia Xia et al.: A dsRNA virus with filamentous viral particled. In: Nature Communications. Band 8, Nr. 168, 2017, doi:10.1038/s41467-017-00237-9
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Colletotrichum camelliae filamentous virus 1 (species)
- ↑ Circulifer tenellus virus 1. Auf: Virus-Host DB
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Circulifer tenellus virus 1 (species)
- ↑ Spissistilus festinus virus 1. Auf: Virus-Host DB.
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Spissistilus festinus virus 1 (species)
- ↑ SIB: Positive Strand RNA Viruses. Auf: ViralZone
- ↑ D. F. Quito-Avila, P. M. Brannen, W. O. Cline, P. F. Harmon, R. R. Martin: Genetic characterization of Blueberry necrotic ring blotch virus, a novel RNA virus with unique genetic features. In: Journal of General Virology. Juni 2013, Band 94, Teil 6, S. 1426–1434, doi:10.1099/vir.0.050393-0, PMID 23486668
- ↑ M. J. Adams, J. F. Antoniw, J. Kreuze: Virgaviridae: a new Familie of rod-shaped plant viruses. In: Archives of Virology. Band 154. Jahrgang, Nr. 12, 2009, S. 1967–1972, doi:10.1007/s00705-009-0506-6, PMID 19862474.
- ↑ SIB: Double Stranded RNA Viruses. Auf: ViralZone.
- ↑ Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja: Virus World as an Evolutionary Network of Viruses and Capsidless Selfish Elements. In: Microbiology and Molecular Biology Reviews. 20. Mai 2014, doi:10.1128/MMBR.00049-13, Figur 3.
- ↑ Fusariviridae (FAMILY). Auf: UniProt Taxonom.
- ↑ FUSARIVIRIDAE, Auf: PLANOSPHERE
- ↑ Fusariviridae. Auf: NCBI Genomes
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Fusariviridae (family)
- ↑ Rosellinia necatrix fusarivirus 1. Auf: Virus-Host DB.
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Rosellinia necatrix fusarivirus 1 (species)
- ↑ ICTV: Alphafusarivirus roselliniae alias „Rosellinia necatrix fusarivirus 1“ wg. Proposal 2021.001F.R.Fusariviridae (docx in zip).
- ↑ SIB: Barnavirus. Auf: ViralZone.
- ↑ SIB: Avastrovirus. Auf: ViralZone.
- ↑ SIB: Mamastrovirus. Auf: ViralZone.
- ↑ Karoline dos Anjos, Tatsuya Nagata, Fernando Lucas de Melo: Complete Genome Sequence of a Novel Bastrovirus Isolated from Raw Sewage. In: Genome Announcements. Oktober 2017, Band 5, Nr. 40, S. e01010-17; doi:10.1128/genomeA.01010-17, PMC 5629051 (freier Volltext) (englisch).
- ↑ Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, M. G. Fischer: A classification system for virophages and satellite viruses. In: Archives of Virology. Band 161, Nr. 1, 2016, S. 233–247; doi:10.1007/s00705-015-2622-9, Epub 7. Oktober 2015.
- ↑ ICTV: Sarthroviridae ( des vom 22. September 2020 im Internet Archive) Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.. Virus Taxonomy: 2019 Release EC 51, Berlin, Germany, July 2019 (MSL #35).
- ↑ SIB: Macronovirus. Auf: ExPASy: ViralZone.
- ↑ SIB: Macronovirus. Auf: ViralZone.
- ↑ D. Qian, Z. Shi, S. Zhang, Z. Cao, W. Liu, L. Li, Y. Xie, I. Cambournac, J.-R. Bonami: Extra small virus-like particles (XSV) and nodavirus associated with whitish muscle disease in the giant freshwater prawn, Macrobrachium rosenbergii. In: Journal of Fish Diseases. Band 26, Nr. 9, September 2003, S. 521-527; PMID 14575370, doi:10.1046/j.1365-2761.2003.00486.x.
- ↑ J. Widada, S. Widada, J. R. Bonami: Characteristics of the monocistronic genome of extra small virus, a virus-like particle associated with Macrobrachium rosenbergii nodavirus: possible candidate for a new Spezies of satellite virus. In: Journal of General Virology. Band 85, Nr. 3, März 2004, S. 643–646; PMID 14993649, doi:10.1099/vir.0.79777-0.
- ↑ Claire L. Webster, Ben Longdon, Samuel H. Lewis, Darren J. Obbard: Twenty-Five New Viruses Associated with the Drosophilidae (Diptera). In: Evolutionary bioinformatics online. 2016, Band 12, Supplement 2, S. 13–25; doi:10.4137/EBO.S39454, PMC 4915790 (freier Volltext), PMID 27375356 (englisch)
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Negevirus (genus, positive-strand ssRNA viruses)
- ↑ J. F. van den Heuvel, H. R. Hummelen, Martin Verbeek, Annette Dullemans: Characteristics of Acyrthosiphon pisum Virus, a Newly Identified Virus Infecting the Pea Aphid. In: Journal of Invertebrate Pathology. November/Dezember 1997, Band 70, Nr. 3, S. 169–176, doi:10.1006/jipa.1997.4691, PMID 9367722
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Acyrthosiphon pisum virus (species, acronym: CAV, equivalent: Chara corallina virus)
- ↑ A. J. Gibbs, M. Torronen, A. M. Mackenzie, J. T. Wood, J. S. Armstrong, H. Kondo, T. Tamada, P. L. Keese: The enigmatic genome of Chara australis virus. In: Journal of General Virology. November 2011, Band 92, Nr. 11, S. 2679–2690; doi:10.1099/vir.0.033852-0, PMID 21733884. Zitat: „It is a ssRNA molecule of 9065 nt with at least four ORFs“
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Chara australis virus (species, positive-strand ssRNA viruses)
- ↑ Kelp fly virus. Auf: Virus-Host DB.
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Kelp fly virus (species, positive-strand ssRNA viruses)
- ↑ Eric Dubois E, Caroline Reis Frank Schurr Nicolas Cougoule, Magali Ribiére-Chabert: Effect of pollen traps on the relapse of chronic bee paralysis virus in honeybee (Apis mellifera) colonies. In: Apidologie. Band 49, Nr. 2, April 2018, S. 235–242; doi:10.1007/s13592-017-0547-x, Epub 12. Oktober 2017.
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Chronic bee paralysis virus (species, acronym: CBPV, positive-strand ssRNA viruses)
- ↑ Marion Heller-Dohmen E, Jens Pfannstiel, Otmar Spring: The nucleotide sequence and genome organization of Plasmopara halstedii virus. In: Virology Journal. Band 8, Nr. 123, 17. März 2011; doi:10.1186/1743-422X-8-123, PMC 3069955 (freier Volltext), PMID 21410989 (englisch).
- ↑ NCBI Taxonomy Browser: Plasmopara halstedii virus A (species)
- ↑ Alan Cann: Principles of Molecular Virology. Academic Press, 2011, ISBN 978-0-12-384939-7.
- ↑ SIB: Negative Strand RNA Viruses. Auf: ViralZone.
- ↑ Gaya K. Amarasinghe et al.: „Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2018“. In: Archives of Virology. Band 163, Nr. 8, August 2018, S. 2283–2294.
- ↑ Claudio L. Afonso et al.: Taxonomy of the order Mononegavirales: update 2016. In: Archives of Virology. Band 161, Nr. 8, 1. August 2016, S. 2351–2360.
- ↑ Jamie Bojko: Animal dsRNA and ssRNA- viruses. Vorschlag an das ICTV vom 15. Oktober 2019. Memento im Webarchiv vom 11. November 2019.
