Als Mikrohabitat (altgriechisch μικρός mikrós, deutsch ‚klein, eng‘, lateinisch habitat- ‚[er, sie, es] bewohnt‘) wird in der Biologie ein Lebensraum mit geringer räumlicher Ausdehnung bezeichnet. Beispiele sind etwa ein Grashorst im Grasland oder der Flechtenrasen auf einer Baumrinde. Mikrohabitate kommen in sehr vielen Variationen vor.

In älterer Literatur wird zwischen mehreren Typen von Mikrohabitaten unterschieden.^[1]

Ein Biochorion, das als besonderes Objekt hervortritt, bildet ein Mikrohabitat. Dies können Aas, Exkremente, Pilze, Tierwohnungen oder umgestürzte Baumstämme sein. Die so gebildete Vergesellschaftung verschiedener Arten wird als Choriozönose bezeichnet.^[1]

Das Merotop ist ein „Strukturteil“, somit Teil einer Struktur und innerhalb dieser mit anderen Strukturteilen gekoppelt. Solche Strukturteile sind beispielsweise eine Oberfläche, feste Bestandteile und natürliche Lücken einer Bodenschicht, ferner Wurzel, Holz oder Rinde eines Baumes, Blätter oder Früchte einer Pflanze. Die hierdurch gebildete Gemeinschaft heißt Merozönose.^[1]

In zeitlicher Hinsicht, besonders auf ihre Lebensdauer bezogen, sind viele Mikrohabitate nicht nur variabel, sondern auch kurzlebig. Zu den kurzlebigen Mikrohabitaten gehören etwa Kadaver, Exkremente, faulende Früchte und Pfützen. Auch ein Blatt oder eine einjährige krautige Pflanze stellt ein solches kurzlebiges Mikrohabitat dar, wenn sie für ihre Konsumenten nur über einen kurzen Zeitraum verzehrbar ist. Aber auch eine Frucht und die sie verzehrenden Insekten können jederzeit von einem Vogel gefressen werden.^[2]

• Habitat
• Baum-Mikrohabitat

• Stefan Nehring, Ute Albrecht: Biotop, Habitat, Mikrohabitat – Ein Diskussionsbeitrag zur Begriffsdefinition. In: Lauterbornia. Band 38, 2000, S. 75–84 (zobodat.at [PDF]). 

1. ↑ ^{a b c} Matthias Schaefer: Wörterbuch der Ökologie. 5. Auflage. Springer-Verlag, Heidelberg 2012, ISBN 978-3-8274-2562-1, S. 172. 
2. ↑ Michael Begon, John L. Harper, Colin R. Townsend: Ökologie – Individuen, Populationen und Lebensgemeinschaften. Springer-Verlag, Basel AG 2013, ISBN 978-3-0348-6156-4, S. 278 f.